工藤新一是全国著名的高中()生侦探,在一次追查黑衣人犯罪团()伙时()不幸被团伙成员发现,击晕后喂了神奇的药水,工藤()新一变回了小孩!新一找到了经常帮助他的阿笠博()士,博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复,新一决定隐姓埋名,暗中追查他们,希望能得到解药。一日(),新一 的女友毛利兰()来到了阿笠()博士的家寻找男友的下落,被小兰撞见的新()一情急之下编造了自己名叫江户川柯南,随后柯南寄居在了小兰家。小兰的()父亲毛利小五郎是一名私家侦探,新一可以籍着和他一起四出办()案一起追查黑夜人的()下落。柯南在小学认识步美等小学生,他们一起组织了一个少年侦探团,向()罪犯宣战!