工藤新一是全国著名的高中生侦探,在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现,击晕后喂了()神奇的药()水,工藤新一变回了小孩!新一找到了经()常帮助他的阿笠博士,博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复(),新()一决定隐姓埋名,暗中追查他们,希望能得到解药。一日,新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落(),被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江()户川柯南(),随后柯南寄()居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探,新一可以籍着()和他一起四出办案一起追查黑夜()人的下落。柯南在小学认识步美等小学生(),他们一起组织了一个少年侦探团,向罪()犯宣战!