工藤新一是全国著名的高中生()侦探,在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现,击晕后喂了神奇的药水,工藤新一变回了小孩!新一找到了()经常帮助他的阿笠博士,博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪()团伙对他进行报()复,新一决定隐姓埋名(),暗中追查他()们,希望能()得到解药。一日,新一 的女友毛利兰来到()了阿笠博士的家寻找男友的下落,被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南,随()后柯南寄居在了小()兰家。小兰的父亲毛利小()五郎是一名私家侦探,新()一可以籍着和他一起四出办案一起追查()黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生,他们一起组织了一个少年侦探团,向罪犯宣战!