工藤新一()是全国著名的高中生侦探,在一次追查黑衣人犯()罪团伙时不幸被团伙成员发现,击晕后喂了神奇的药水,工藤新一变回了小孩!新()一找到了经常帮助他的阿笠博()士,博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止()犯罪团伙对他进行报复,新一决定隐姓埋名,暗中追查()他们,希望能得到解药。一日,新一 的女友毛利兰()来()到了阿笠博()士的家寻找男友的下落,被()小兰撞见的新一情急之下编造了自()己名叫江户川柯南,随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探,新一可以籍着和他一起四出办案一起追查()黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生,他们一起组织了一个少年侦探团,向罪犯宣()战!