工藤新一是全国著名的高中生侦探,在一次追查黑衣人犯罪()团伙时不幸被()团伙成员发现,击晕后喂了神奇的药水,工藤新一变回了小孩!新一找到了经常帮助他的阿笠博士,博士为他度身()打造不少间谍武器()。为了防止犯罪团伙对他进行报复,新一决定隐姓埋名,暗中追查他们,希望能得到解药。一日,新一 的女友()毛利兰来到了阿笠博士的家寻()找男友的下落,被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南,随后()柯南寄居在了小兰家。小兰的父()亲毛利小五郎是一名私家侦探,新一()可以籍着和他一起四出办案一起追查()黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生(),他()们一起组织了一个少年侦探团,向()罪犯宣战!